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来源:小桔灯网

4月22日晚

微光学院联合杰毅生物

共同举办的“说感染”临床感染专家在线精品系列讲座(第二期)通过线上直播的方式进行。本期讲座的特邀嘉宾为南京大医院呼吸与危重症医学科施毅教授和杰毅生物创始人CEO王珺博士。

施毅教授讲课主题为

“肺部感染治疗从经验到精准”

施教授表示近几年传染病重大疫情频发,疫情爆发时发病急、进展快、传染性强,因此传染病原体的快速、准确鉴定是控制疫情的关键因素。施教授以新冠疫情为例,介绍了感染性疾病诊断的临床痛点。目前传统病原体检测方法往往检测周期较长,覆盖的病原体有限,且无法进行混合复杂感染及未知病原体的检测,因而造成临床上抗生素的过度使用以及产生抗生素耐药问题。病原宏基因组检测(mNGS)是一种不依赖于培养、无需提前假设、无偏倚、广覆盖、灵敏、准确、快速的病原学诊断方法,可有效用于临床感染病原体的明确。

施教授介绍了众多mNGS应用于呼吸系统感染诊断中的前沿文献,以及病原mNGS报告的解读原则,如需结合临床确定病原体、有些情况下即使1条序列数也有意义,比如结核、隐球菌等,可以有效指导用药。施教授肯定了mNGS在临床感染性疾病诊断中发挥的重要作用,同时也指出mNGS仍存在需要优化和发展的方向,如去人源宿主序列、针对胞内菌/厚壁微生物的破壁、耐药、毒力检测等。

最后,施教授大力赞扬了杰毅生物mNGS检测速度快,以及应用自主研发的NGSmasterTM自动化建库仪来降低背景菌污染等优点,并对杰毅医院宏基因组测序中心对新冠患者mNGS检测工作表示肯定。

王珺博士此次向大家分享了

“去人源技术在呼吸道mNGS检测中的应用”

王博士表示mNGS是一种将样本中所有微生物“一网打尽”进行检测的方法,但同时也会将样本中所包含的大量的人源核酸“收在网里”而影响检测灵敏度,mNGS的检出限和人源细胞比例呈现负相关性。

肺泡灌洗液(BALF)是呼吸系统感染mNGS检测中的常见样本类型,不同BALF样本中的人源细胞比例波动范围较大(~),因此单纯将测序数据量从20M提升至M(增加5倍)甚至0M(增加50倍)也不能消除样本中近00倍的人源背景差距。王博士展示了不同测序量的临床样本中微生物的检出reads情况,表示测序量更高,微生物的检出reads并不会更高。

王博士介绍了

目前应用于“去人源”的策略和方法

以及杰毅生物自主研发的去人源方法

该方法可在单管中经一步操作快速完成(仅需15min),对设备无特殊要求,并可与杰毅生物采用的PCR-free建库方法无缝衔接,显著降低了人源背景,提升了微生物的检出。王博士表示去人源技术的目的并非是为了降低测序量、节约成本,而是为了更好地检出病原体。有些高人源样本如呼吸道样本(人源背景波动大)简单提高数据量效果不大,需要采用去人源技术才能检出,但并不是所有样本都适用于去人源技术,因为去人源后的建库起始量会偏低,目标病原被放大的同时,背景微生物也会被同步放大,增加解读难度(特别是低起始量样本),因此不建议对低人源样本进行去人源处理。

此次直播已告一段落,但精彩仍在继续

下一期“说感染”临床感染专家在线精品系列讲座

杰毅生物将邀请中国医院的

陈佰义教授于5月15日参与分享

内容精彩,敬请期待!

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